马克思主义学院可追溯到1958年黔东南大学设置的政治教研室。之后学校几经变迁，1978年4月，恢复黔东南民族师范专科学校，继续设置政治教研室，承担全校公共政治课教学；1980年学校设立政教科开办政治教育专业，政治教研室同时并入政教科，负责政治教育专业和全校公共政治课教学。

1984年学校单独设立思想品德教育教研室，直属校党委二级教研机构，负责全校思想品德公共课教学；1989年学校设立马克思主义理论教育教研室，同年10月与思想品德教育教研室合署办公，1996年升为副处级教学机构；2003年9月根据州编发（2003）36号文件批复，将“马克思主义理论教育教研室”和“思想品德教育教研室”合并设立马列主义教研部，为副处级教学机构；2008年8月，根据州编发（2008）17号文件批复，中国足球彩票马列主义教研部设为正处级教学机构，承担全校思想政治理论课教学。

1988年政教科更名为政史系，招生专业为政治与历史教育，实现双专业（主辅修）人才培养；1996年升为副处级教学机构，2003年政史系更名为政治经济系；2008年政治经济系更名为中国足球彩票法政学院，设为正处级教学机构。

2012年根据州编发（2011）66号文件批复，以马列主义教研部为基础，整合法政学院的思政教育专业教学资源组建马克思主义学院至今（同时，法政学院改建为经济管理学院），承担思想政治教育专业和全校思想政治理论课教学。